徠卡顯微鏡FRET與FLIM定量在體內(nèi)生物化學(xué)
熒光壽命是多久熒光團(tuán)保留在平均在激發(fā)態(tài)通過(guò)發(fā)射熒光光子返回到基態(tài)之前的量度。它依賴(lài)于熒光團(tuán)的分子的組合物和納米環(huán)境。
FLIM結(jié)合壽命測(cè)量與成像:為每個(gè)圖像像素獲得的壽命是顏色編碼,以產(chǎn)生更多的圖像對(duì)比度。因此,F(xiàn)LIM有關(guān)其生化狀態(tài)或納米環(huán)境的信息提供關(guān)于熒光分子的空間分布的信息一起。FLIM的一個(gè)典型應(yīng)用是FLIM-FRET。FRET是一個(gè)行之有效的方法來(lái)研究分子間的相互作用。它審視蛋白結(jié)合,并估計(jì)在一個(gè)規(guī)模埃距離間也。
FRET - 原理
熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)描述的能量存儲(chǔ)在激發(fā)的熒光分子(供體),以非激發(fā)不同的熒光分子(受體)在其附近的非輻射轉(zhuǎn)移。 三個(gè)條件必須滿(mǎn)足FRET發(fā)生:
圖1:供體(ECFP這里,藍(lán)線(xiàn))的發(fā)射光譜必須與受體的激發(fā)光譜(這里EYFP,黃線(xiàn))重疊。這個(gè)要求意味著兩個(gè)分子在FRET對(duì)具有兼容的能量水平。
圖2:供體分子(D)是通過(guò)從受體分子(A)的距離為r隔開(kāi)。
圖3:在距離r小于閾值R 0,也稱(chēng)為福斯特半徑大得多,沒(méi)有能量傳遞。
圖4:如果分子處于緊密接觸能量從激磁光子(藍(lán)色箭頭)被傳非輻射到受體。 反過(guò)來(lái),后者發(fā)射光子(黃色箭頭)。 這個(gè)處理(E)的效率強(qiáng)烈地依賴(lài)距離為r -6。
影響
由于其隨r強(qiáng)距離相關(guān)-6(圖4)的FRET發(fā)生在一個(gè)空間尺度是用于生化反應(yīng),如蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)-DNA相互作用高度相關(guān)。 FRET可以通過(guò)靈敏的熒光讀出探測(cè)分子間的相互作用。 這使得研究人員研究在體外和體內(nèi)分子間的相互作用。通過(guò)將與適宜的熒光標(biāo)記感興趣的兩個(gè)相互作用配偶能夠分析雙分子相互作用??商娲?,F(xiàn)RET允許生物探針報(bào)告的第二信使或離子強(qiáng)度由分子內(nèi)FRET的手段濃度的結(jié)構(gòu),由于強(qiáng)的構(gòu)象變化。
毫不奇怪,F(xiàn)RET已發(fā)展成為細(xì)胞生物學(xué),生物物理學(xué)和生物醫(yī)學(xué)成像廣泛使用的工具。
該方法
有不同的技術(shù)來(lái)檢測(cè)FRET在顯微鏡的情況下。俗稱(chēng)的基礎(chǔ)上無(wú)論是供體(受體 - 漂白,F(xiàn)RET AB)或受體(致敏的排放,F(xiàn)RET SE)的熒光強(qiáng)度的技術(shù)。
基于強(qiáng)度的FRET可以使用標(biāo)準(zhǔn)共焦顯微鏡可以容易地應(yīng)用。 然而,它也有一些缺點(diǎn)。FRET AB不能在時(shí)間系列實(shí)驗(yàn)被應(yīng)用并易受可逆漂白的供體分子或光轉(zhuǎn)化。FRET SE,另一方面,患有光譜串?dāng)_固有所有FRET對(duì),需要仔細(xì)校準(zhǔn)測(cè)量以及產(chǎn)生的圖像的線(xiàn)性分解。 本申請(qǐng)書(shū)介紹了一種不同的方法來(lái)測(cè)量FRET是基于熒光壽命成像顯微術(shù)(FLIM)。
熒光壽命
熒光的過(guò)程常常被理解分子中(圖5,左)從電子基態(tài)(S 0)到激發(fā)態(tài)(S 1)項(xiàng)的能量轉(zhuǎn)換。這種轉(zhuǎn)變可以由入射光與適當(dāng)?shù)哪芰浚搭l率或波長(zhǎng))被引出。 所吸收的能量被熒光分子存儲(chǔ)短時(shí)間才可以發(fā)出熒光。一個(gè)分子在其激發(fā)態(tài)的時(shí)間被稱(chēng)為熒光壽命。 它典型地在納秒(10 -9秒 ),用于許多有機(jī)染料和熒光壽命蛋白質(zhì)的順序。
熒光壽命和FRET
另一種方法,以放松從激發(fā)態(tài)是,例如,F(xiàn)RET。通過(guò)FRET激發(fā)能量是非輻射地轉(zhuǎn)移到受體分子。反過(guò)來(lái)接受器可以通過(guò)熒光(圖5,右)放松。 由于供體熒光和能量轉(zhuǎn)移是競(jìng)爭(zhēng)過(guò)程的消耗率的激發(fā)態(tài)增加FRET的存在。有人可能會(huì)說(shuō),時(shí)間越長(zhǎng),供體分子度過(guò)處于興奮狀態(tài)就越有可能的是,F(xiàn)RET發(fā)生。 僅僅從供體分子的光子通過(guò)它放松熒光觀察。能量轉(zhuǎn)移到受體分子不因受體熒光的波長(zhǎng)更長(zhǎng)的檢測(cè)。 因此,F(xiàn)RET縮短壽命捐助(圖6)。
圖5:在FRET對(duì)能源的過(guò)渡。 光能匹配的供體分子的過(guò)渡被吸收(藍(lán)色箭頭)。 興奮的捐贈(zèng)者可以放松或者通過(guò)熒光(灰色虛線(xiàn)箭頭,左)或共振能量轉(zhuǎn)移到受體分子(黑色箭頭)。
圖6:激發(fā)后繪制的熒光光子數(shù)在經(jīng)過(guò)時(shí)間。 激勵(lì)脈沖后發(fā)射的光子的初始數(shù)量,一個(gè)0,呈指數(shù)衰減。 熒光需要時(shí)間衰變到一個(gè)0 / E(?37%)是熒光壽命。 壽命τ轉(zhuǎn)移到更短的時(shí)間,由于FRET(τ淬火 )。另一種讀出從壽命衰減幅度為0。在掃描系統(tǒng)中的每個(gè)位置測(cè)量的壽命產(chǎn)生壽命(見(jiàn)插圖)的空間地圖。
熒光壽命成像(FLIM)
使用脈沖激光器和單光子計(jì)數(shù)探測(cè)器在Leica TCS SMD系列測(cè)量在時(shí)域熒光壽命。壽命是通過(guò)建立檢測(cè)熒光事件的直方圖來(lái)確定。這揭示了一個(gè)單或多指數(shù)熒光衰減。 數(shù)值曲線(xiàn)擬合呈現(xiàn)熒光壽命和振幅(即,檢測(cè)到的光子數(shù))。(
FLIM-FRET
由于FRET減少捐助壽命可以量化到FRET發(fā)生時(shí),提供無(wú)FRET供體的壽命是已知的程度。這個(gè)供體壽命τ用作*參考針對(duì)其FRET樣品進(jìn)行了分析。 因此,F(xiàn)LIM-FRET是內(nèi)部校準(zhǔn) - 一個(gè)屬性減輕許多的基于強(qiáng)度的FRET測(cè)量的缺點(diǎn)。因?yàn)樗臒晒鈮勖且环N染料的固有屬性是廣泛不變的,否則不利影響如漂白,圖像陰影,不同濃度或表達(dá)水平。
主要的使用限制強(qiáng)度基于FRET測(cè)量的基本假設(shè)所有觀察到的捐助分子發(fā)生FRET。這通常不是這樣的。 供體分子的這種變化的“綁定”部分介紹了相當(dāng)大的不確定性所測(cè)得的FRET效率,使實(shí)驗(yàn)無(wú)法進(jìn)行比較。 FLIM-FRET克服了這一缺點(diǎn)。
拍攝使用活細(xì)胞圖像FLIM
如前面提到的,F(xiàn)RET效率從微動(dòng)施主壽命τ 驟冷過(guò)的非微動(dòng)壽命τ作為的比值來(lái)計(jì)算:
為此τ必須從測(cè)量使用包含施主只有一個(gè)樣品已知的。 它排除從受任何排放量是很重要的。 使用外部檢測(cè)器必須使用一個(gè)帶通濾波器。 內(nèi)部檢測(cè)器可被調(diào)節(jié)以只記錄供體發(fā)射。 相同的設(shè)置,必須同時(shí)用于donoronly測(cè)量以及使用FRET樣品的測(cè)定。
CFP-YFP FRET活細(xì)胞
在這項(xiàng)工作中,我們使用培養(yǎng)RBKB78細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染了熒光共振能量轉(zhuǎn)移構(gòu)建體組成的CFP-YFP的融合蛋白質(zhì)(圖7)的。 兩個(gè)的FP通過(guò)兩個(gè)氨基酸的短的接頭連接。這樣的供體 - 受體融合也可以作為在真實(shí)的場(chǎng)景中一個(gè)很好的陽(yáng)性對(duì)照FRET?!熬柚?的”樣本包括轉(zhuǎn)CFP只(圖7A)相同的細(xì)胞。 作為*近似的平均壽命是計(jì)算在快速FLIM的模式,對(duì)于兩個(gè),只有供體和FRET樣品(圖7B)。壽命分布直方圖顯示,供體的平均壽命τ是2.1納秒(圖8)。在FRET結(jié)構(gòu)的供體的壽命是1.4納秒。 其中獲得一個(gè)FRET效率E = 1 - (1.4 / 2.1)= 33%。
頂行:圖7:RBKB78細(xì)胞轉(zhuǎn)染與CFP供體只(A)和CFP-YFP融合(B)。 該檢測(cè)范圍是使用光譜FLIM探測(cè)器設(shè)置445-495納米之間。 著色區(qū)域已被用于分析。 顏色代表調(diào)強(qiáng)熒光壽命。 禮貌教授格雷戈里·哈姆斯,維爾茨堡,德國(guó)的大學(xué)。 我們承認(rèn)實(shí)驗(yàn)支持由本尼迪克特克萊默博士(Picoquant,柏林),揚(yáng) - 亨德里克Spille和WIEBKE巴克
下排:圖。 8:供體熒光壽命分布只(黃色),并使用平均壽命FRET(綠)的樣品。 還有就是0.7納秒對(duì)FRET樣品中壽命較短一個(gè)明顯轉(zhuǎn)變。
FRET的比例與無(wú)FRET
它是已知的CFP到具有至少兩個(gè)壽命部件在自己的權(quán)利。此外,它是不知道所研究的所有分子是否發(fā)生FRET先驗(yàn)。為了公平對(duì)待這種復(fù)雜性人們需要對(duì)*過(guò)平均壽命的信息。我們可以進(jìn)行雙組分配合,這將給我們兩個(gè)人的壽命和兩個(gè)振幅。后者允許我們估計(jì)一個(gè)人一生中的相對(duì)比例比其他。 特別是,使用的振幅,我們可以估算該分?jǐn)?shù)表現(xiàn)出FRET(結(jié)合級(jí)分)和未表現(xiàn)出FRET(未結(jié)合部分)的級(jí)分的相對(duì)比例。 fps的微弱第二部分,如EGFP或藍(lán)寶石非常適合這種類(lèi)型的分析。