徠卡顯微鏡熒光蛋白光譜特性的簡介
熒光顯微鏡的前景極大地改變熒光蛋白在20世紀(jì)50年代的發(fā)現(xiàn)。 其出發(fā)點(diǎn)是水母水母綠色熒光蛋白(GFP)通過檢測Osamo下村 。 數(shù)百GFP的突變體后,熒光蛋白的范圍達(dá)到從藍(lán)色到紅色的光譜。 更多的熒光蛋白來自其它物種的像珊瑚蟲未來的出現(xiàn)偏移發(fā)射波長連到遠(yuǎn)紅外區(qū)。 的可能性,這個(gè)調(diào)色板提供了科學(xué)家尋找他們的需求的絕佳選擇合適的熒光蛋白標(biāo)記。 本文提供的最新替代品的概述,并提供了明確安排表中所有相關(guān)的光譜特性。
從 A熒光蛋白 維多利亞
綠色熒光蛋白或其變體的光譜特性在于氨基酸結(jié)構(gòu)上形成的發(fā)色團(tuán) (圖1)。這可以是在3位的氨基酸65-67或殘基的接近這個(gè)位置(例如YFP)。 除了關(guān)于發(fā)色團(tuán)的主要突變,研究還對其他位點(diǎn)定向誘變進(jìn)行,以提高其它因素,如蛋白質(zhì)的成熟和表達(dá)在異種細(xì)胞系統(tǒng)(例如,密碼子使用,蛋白質(zhì)折疊在生理溫度下)。 需要注意的是A. 維多利亞是一個(gè)比較原始的海洋生物,無全身發(fā)熱系統(tǒng)。
即使GFP是因?yàn)樗牧炼群透吖夥€(wěn)定性的最流行的FP中的一個(gè),它有兩個(gè)主要的缺點(diǎn)。 這些都是一定的敏感性至pH和輕微趨勢二聚化。 二聚化或寡聚化是許多FP的一個(gè)問題。 他們的偏好凝集彼此可產(chǎn)生偽像或關(guān)于融合蛋白的定位和功能的誤解。 但是,科學(xué)家們想出了一些答案的問題了。 其中,非極性氨基酸被親水性的物品所取代的突變,在臨界位置(F223R,L221K和A206K)顯示降低的二聚化。 所有這一切都導(dǎo)致頻譜的改善以及實(shí)際性狀的遺傳變化進(jìn)行了總結(jié)下“強(qiáng)化”的FP的名字。
在wtGFP的情況下,增強(qiáng)導(dǎo)致的EGFP(增強(qiáng)型綠色熒光蛋白)與在488nm處,而不是以前復(fù)雜的吸收光譜在395納米和475納米的單激發(fā)峰。 wtGFP的第一個(gè)變異版本(S65T突變)由Roger錢永健等人開發(fā)的。 比原來更亮5倍,并呈現(xiàn)出更短的熟化時(shí)間。 連同更好熟化效率,在37℃,根據(jù)另一個(gè)突變(F64L),這起著對人們在看活細(xì)胞中起重要作用。
一個(gè)非常有趣的GFP變體的最大的斯托克斯位移一個(gè)是藍(lán)寶石 。 的突變的位置附近的發(fā)色團(tuán)(T203I)導(dǎo)致的最大激發(fā)至399納米,最大發(fā)射至511毫微米的改變。 這是112毫微米的斯托克斯位移。 翡翠是另一個(gè)GFP的修飾具有改進(jìn)的光穩(wěn)定性和亮度和更有效的折疊在哺乳動物細(xì)胞中。
而所有的綠色熒光蛋白具有相對較高的亮度,藍(lán)色熒光蛋白通常從微觀的應(yīng)用減少了發(fā)光強(qiáng)度受到影響。 然而,它們用在因其他光譜特性的光學(xué)測定法。EBFP(增強(qiáng)型藍(lán)色熒光蛋白),通過多輪突變wtGFP構(gòu)成。 第一個(gè)(Y66H)跳過從綠色發(fā)光峰的藍(lán)色光譜。 多個(gè)突變,隨后,產(chǎn)生的蛋白質(zhì)具有最大激發(fā),在380nm處,并在發(fā)光最大值位于448納米。 這些光譜特性使其成為EGFP在FRET徠卡顯微鏡的合作伙伴。 最近的藍(lán)色熒光蛋白具有較高的量子產(chǎn)率和更好的耐光性是石青,SBFP2和EBFP2。 一個(gè)有前途的EBFP繼任者是一個(gè)名為天狼這成為由于其極高的耐受性pH值(pH值從3-9穩(wěn)定)和其是用最短的發(fā)射波長至今的熒光蛋白信譽(yù)流行的一種蛋白質(zhì)。
第二個(gè)“藍(lán)色”類的GFP變異體是由青色熒光蛋白的形成: 國家重點(diǎn)計(jì)劃 。 酪氨酸與色氨酸(Y66W)和進(jìn)一步的遺傳改變的置換導(dǎo)致具有改善的亮度和光熒光染料。 這ECFP具有雙峰的激發(fā)和發(fā)射光譜在433/445 nm 和475/503 nm納米。 亮度是只有大約40%的該綠色熒光蛋白。 一個(gè)突出的ECFP變體是蔚藍(lán) ,它具有更高的消光系數(shù)和量子產(chǎn)率。 它比ECFP更亮的1.5倍,并用作與YFP FRET的一個(gè)伙伴。
甲GFP的突變不直接改變中的發(fā)色團(tuán)的三個(gè)中心氨基酸之一導(dǎo)致黃色熒光蛋白的升高。YFPs具有由酪氨酸(T203Y)交換一個(gè)共同的蘇氨酸,在位置203。 這種氨基酸是β桶的一部分,并位于靠近所述發(fā)色團(tuán)。 相比于綠色熒光蛋白,激發(fā)和發(fā)射屬性已被轉(zhuǎn)換到更長的波長與激發(fā)和發(fā)射最大值在514納米和527納米(EYFP)。EYFP的一個(gè)特征是它的pH值敏感性。 在pH6.5 EYFP只有約50%的熒光,這并不總是一個(gè)缺點(diǎn)。 當(dāng)涉及到pH測量(如囊泡,內(nèi)體等),EYFP,可作為一個(gè)指標(biāo)。 有趣的是,另外的突變(Q69M)開發(fā)出一種更好的酸穩(wěn)定性,并顯著改善了亮度(比EGFP亮的75%)。 這種蛋白質(zhì),它仍具有光穩(wěn)定性較差相比,EGFP,被稱為黃水晶 。 另一個(gè)YFP的突變體(F46L)呈顯著更快的成熟速度并且還改進(jìn)的pH值電阻。 這種蛋白質(zhì)被命名為金星 ,是一種常見的FRET受體與蔚藍(lán)。
從珊瑚蟲熒光蛋白
正如人們可以從第一部分看到,大多數(shù)的FP,來自水母答來 維多利亞發(fā)射光中的藍(lán)色到黃色的光譜。 紅色熒光蛋白的缺失。 俄羅斯科學(xué)家Sergey A. Lukyanov封閉的差距時(shí),他發(fā)現(xiàn)的FP的珊瑚蟲。 紅色的FP具有比其他的一大優(yōu)勢,因?yàn)樵诩?xì)胞中的紅色光譜少得多的自體熒光。 此外,他們通過較長的波長,這是很好的活細(xì)胞興奮。 較短波長的光確實(shí)給標(biāo)本遠(yuǎn)遠(yuǎn)更大的傷害。 珊瑚蛋白的過度水母蛋白的另一個(gè)一般性的優(yōu)點(diǎn)是在37℃下它們的有效的成熟。 而A. 維多利亞 GFP和衍生物不得不被遺傳修飾,以正確的方式折疊,珊瑚蟲綱蛋白成熟而不分子工程的必要性。 這可能是由于其生境的溫暖水溫。
圖2:紅色熒光蛋白的分子結(jié)構(gòu)
發(fā)現(xiàn)在珊瑚蟲最常用的FP的第一和靜止1是紅色熒光蛋白 。 這個(gè)名字是從???em>香菇芨而得。 紅色熒光蛋白具有最大激發(fā),在558 nm和583 nm的發(fā)射峰。 然而,第一欣快停滯時(shí)結(jié)構(gòu)信息發(fā)布。 紅色熒光蛋白maturates遠(yuǎn)遠(yuǎn)慢于水母的FP和具有中間色團(tuán)的階段。 這一階段發(fā)出的光在綠色光譜和成因等FPS重疊。如已經(jīng)在GFP節(jié)所提到的,紅色熒光蛋白也有另一個(gè)問題。 紅色熒光??鞍资且环N專性四聚體的傾向,以形成低聚物。 這可導(dǎo)致關(guān)于融合蛋白的定位和功能的誤解。 在一般的珊瑚蟲的FP具有相似的結(jié)構(gòu),以該多管水母FP的。 發(fā)色是藏在β桶結(jié)構(gòu),具有4納米×3納米(高×直徑)的大小。 不同之處在于,在珊瑚蟲β桶(圖2)的多橢圓形外觀。
與此同時(shí),以綠色熒光蛋白“進(jìn)化”,研究人員開始修改原來的紅色熒光蛋白,以克服其結(jié)構(gòu)性缺陷。 第二紅色熒光蛋白產(chǎn)生- 的DsRed2 -具有減小的寡聚物形成趨勢和更快的成熟速度,減少綠色發(fā)光的中間階段。 進(jìn)一步誘變導(dǎo)致了紅色的FP其中已完全喪失其四聚體狀態(tài),但也喪失了一些它的量子產(chǎn)率(的DsRed2的25%)。 錢學(xué)森等人的這項(xiàng)工作。 是第一單體紅色熒光蛋白,因此被稱為mRFP1。
這mRFP1然后起點(diǎn)創(chuàng)立一組六單體的FP統(tǒng)稱為“mFruit”的。 他們的個(gè)人名得自其發(fā)光色:mHoneydew,mBanana,魔橙,mTangerine,mStrawberry和mCherry mCherry是最有用的,這些FP的,具有50%的該綠色熒光蛋白的亮度發(fā)射光中的610納米范圍內(nèi)。
最亮的FP到目前為止是mFruit派的追隨者,并具有名稱tdTomato。 只要它被遺傳改變,dTomato是一種專性二聚體。 但二聚化被避免通過將兩個(gè)二聚化的伙伴在一個(gè)分子。 兩dTomato單元由一個(gè)12個(gè)氨基酸的接頭偶聯(lián),產(chǎn)生串聯(lián)二聚體的FP tdTomato具有發(fā)射最大值在581納米和在最高的區(qū)域中的光穩(wěn)定性。
發(fā)射光譜,進(jìn)一步移入遠(yuǎn)紅光區(qū)域(630納米- 700納米)已創(chuàng)建另一個(gè)mFruit后繼時(shí)mPlum是mFruit構(gòu)件與任何mFruit蛋白質(zhì)在649 nm的最深的紅色發(fā)光。
科學(xué)地使用綠色熒光珊瑚蟲綱的蛋白質(zhì)的量是非常小的,這是不令人驚奇鑒于公知的,用戶友好的A的情況的維多利亞 GFP。 顯然,人們并沒有看到任何必要建立一個(gè)新的綠色熒光蛋白。 不過也有一些,比如從石珊瑚Galaxeidae,Azami綠色明亮的熒光蛋白。 其序列同源性與綠色熒光蛋白是有趣小于6%。
一個(gè)珊瑚蟲綱FP這對深部組織成像的高影響Katushka。 對招標(biāo)書的E.未來應(yīng)用誘變 ???/em> ,Katushka被鑒定為具有發(fā)射最大值在635納米和所有的深紅色熒光蛋白的最高亮度級一種二聚體蛋白質(zhì)。 Katushka的單體形式被稱為mKate并具有較高的亮度,供給以后,產(chǎn)生mKate2。
總之,所有這些今天用于顯微術(shù),熒光蛋白是來自于原始的海洋生物。 表1包括最重要的那些連同像激發(fā)和發(fā)射最大值,耐光性,量子產(chǎn)率和亮度及其相關(guān)的光譜特性。
展望
什么被證明是一個(gè)非常有趣的故事是由脊椎動物表達(dá)了FP的發(fā)現(xiàn)。 文昌魚,一條小魚般的海洋脊索動物,產(chǎn)生AmphiGFP在其前側(cè)。 那個(gè)FP的序列分析預(yù)測一個(gè)典型的β桶結(jié)構(gòu),似乎是相關(guān)的橈足類Pontellina plumata的CopGFP(甲殼綱)。 這一發(fā)現(xiàn)表明,熒光的現(xiàn)象并不限于原始的無脊椎動物,但也可以在更高的進(jìn)化階段動物中發(fā)現(xiàn)。 此外,這一發(fā)現(xiàn)表明熒光蛋白的發(fā)現(xiàn),處理和增強(qiáng)這仍然是研究的熱門話題的持續(xù)的過程。 這一事實(shí)證實(shí)的重要性和熒光蛋白在近期和未來生命科學(xué)研究的高沖擊。
熒光蛋白的光譜特性
表1:熒光蛋白
Ex:激發(fā)波長峰值(nm)
Em:發(fā)射波長峰值(nm)
MW:分子量
QY:量子產(chǎn)率
BR:亮度; 消光系數(shù)*量子產(chǎn)率/ 1000
PS:耐光性; 時(shí)間以50%的亮度(秒)
熒光蛋白 | ||||||||
Ex (nm) | Em (nm) | MW | QY | BR | PS | Source | Other | |
Y66H | 360 | 442 | ||||||
Y66F | 360 | 508 | ||||||
EBFP | 380 | 440 | 0.18 | 9 | Addgene | Monomer | ||
EBFP2 | 383 | 448 | 0.56 | 18 | Addgene | Monomer | ||
Azurite | 383 | 447 | 0.55 | 14 | Monomer | |||
GFPuv | 385 | 508 | ||||||
T-Sapphire | 399 | 511 | 0.60 | 26 | 25 | Weak dimer | ||
TagBFP | 402 | 457 | 26 k | 0.63 | 33 | ++ | Evrogen | Monomer |
Cerulean | 433 | 475 | 0.62 | 27 | 36 | Weak dimer | ||
mCFP | 433 | 475 | 0.40 | 13 | 64 | Monomer | ||
ECFP | 434 | 477 | 0.15 | 3 | ||||
CyPet | 435 | 477 | 0.51 | 18 | 59 | Weak dimer | ||
Y66W | 436 | 485 | ||||||
dKeima-Red | 440 | 616 | 0.31 | 8 | MBL | Dimer | ||
mKeima-Red | 440 | 620 | 0.24 | 3 | MBL | Monomer | ||
TagCFP | 458 | 480 | 0.57 | 29 | Evrogen | Dimer | ||
AmCyan1 | 458 | 489 | 0.75 | 29 | Clontech | Tetramer | ||
mTFP1 (Teal) | 462 | 492 | 0.85 | 54 | Dimer | |||
S65A | 471 | 504 | ||||||
Midoriishi-Cyan | 472 | 495 | 0.9 | 25 | MBL | Dimer | ||
Wild Type GFP | 396,475 | 508 | 26 k | 0.77 | 16 | |||
S65C | 479 | 507 | ||||||
TurboGFP | 482 | 502 | 26 k | 0.53 | 37 | Evrogen | Dimer | |
TagGFP | 482 | 505 | 27 k | 0.59 | 34 | ++ | Evrogen | Monomer |
TagGFP2 | 483 | 506 | 27 k | 0.6 | 34 | ++ | Evrogen | Monomer |
AcGFP1 | 484 | 510 | 27 k | 0.82 | 27 | Clontech | ||
S65L | 484 | 510 | ||||||
Emerald | 487 | 509 | 0.68 | 39 | 0.69 | Invitrogen | Weak dimer | |
S65T | 488 | 511 | ||||||
EGFP | 488 | 507 | 26 k | 0.60 | 34 | 174 | Addgene | Weak dimer |
Azami-Green | 492 | 505 | 0.74 | 41 | MBL | Tetramer (monomeric available) | ||
ZsGreen1 | 493 | 505 | 105 k | 0.91 | 40 | Clontech | Tetramer | |
Dronpa-Green | 503 | 518 | 0.85 | 81 | MBL | Photoswitchable | ||
TagYFP | 508 | 524 | 27 k | 0.62 | 47 | Evrogen | Monomer | |
EYFP | 514 | 527 | 26 k | 0.61 | 51 | 60 | Weak dimer | |
Topaz | 514 | 527 | 0.60 | 57 | Monomer | |||
Venus | 515 | 528 | 0.57 | 53 | 15 | Weak dimer | ||
mCitrine | 516 | 529 | 0.76 | 59 | 49 | Monomer | ||
>YPet | 517 | 530 | 0.77 | 80 | 49 | Weak dimer | ||
TurboYFP | 525 | 538 | 26 k | 0.53 | 56 | Evrogen | Dimer | |
PhiYFP | 525 | 537 | 26.8 k | 0.40 | 52 | ++ | Evrogen | Weak dimer |
PhiYFP-m | 525 | 537 | 26.8 k | 0.39 | 48 | ++ | Evrogen | Monomer |
ZsYellow1 | 529 | 539 | 0.65 | 13 | Clontech | Tetramer | ||
mBanana | 540 | 553 | 0.70 | 4 | Clontech | Monomer | ||
Kusabira-Orange | 548 | 559 | 0.60 | 31 | MBL | Monomer | ||
mOrange | 548 | 562 | 0.69 | 49 | 9 | Monomer | ||
mOrange2 | 549 | 565 | 0.60 | 35 | Clontech | Monomer | ||
mKO | 548 | 559 | 0.60 | 31 | 122 | Monomer | ||
TurboRFP | 553 | 574 | 26 k | 0.67 | 62 | Evrogen | Dimer | |
tdTomato | 554 | 581 | 0.69 | 95 | 98 | Clontech | Tandem dimer | |
DsRed-Express2 | 554 | 591 | 0.42 | 15 | Clontech | |||
TagRFP | 555 | 584 | 27 k | 0.48 | 48 | Evrogen | Monomer | |
DsRed monomer | 557 | 592 | ~28 k | 0.1 | 3.5 | 16 | Clontech | Monomer |
DsRed2 ("RFP") | 563 | 582 | ~110 k | 0.55 | 24 | Clontech | ||
mStrawberry | 574 | 596 | 0.29 | 26 | 15 | Clontech | Monomer | |
TurboFP602 | 574 | 602 | 26 k | 0.35 | 26 | Evrogen | Dimer | |
AsRed2 | 576 | 592 | ~110 k | 0.21 | 13 | Clontech | Tetramer | |
mRFP1 | 584 | 607 | ~30 k | 0.25 | Tsien lab | Monomer | ||
J-Red | 584 | 610 | 0.20 | 8.8 | 13 | Dimer | ||
mCherry | 587 | 610 | 0.22 | 16 | 96 | Clontech | Monomer | |
HcRed1 | 588 | 618 | ~52 k | 0.03 | 0.6 | Clontech | Dimer | |
mKate2 | 588 | 633 | 26 k | 0.40 | 25 | + | Evrogen | Monomer |
Katushka (TurboFP635) | 588 | 635 | 26 k | 0.34 | 22 | ++ | Evrogen | Dimer |
mKate (TagFP635) | 588 | 635 | 0.30 | 15 | Evrogen | Monomer | ||
TurboFP635 | 588 | 635 | 26 k | 0.34 | 22 | Evrogen | Dimer | |
mPlum | 590 | 649 | 0.10 | 4.1 | 53 | Clontech | ||
mRaspberry | 598 | 625 | 0.15 | 13 | Clontech | Monomer; faster photobleach than mPlum | ||
mNeptune | 600 | 650 | 0.20 | 13 | Tsien Lab | Monomer | ||
E2-Crimson | 611 | 646 | 0.23 | 29 | Clontech |