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徠卡顯微鏡:螢光蛋白及熒光計(jì)時(shí)器

2020-09-04 09:27:59

術(shù)語“螢光蛋白”結(jié)合了一組基因改變的熒光蛋白,具有非常特殊的屬性:它們可以從一個(gè)非熒光狀態(tài)激活,他們可以改變他們的發(fā)射光譜或進(jìn)行切換和關(guān)閉,他們甚至能夠“為很多次。此行為是由于一些獨(dú)特的照片的物理屬性。在單分子水平,許多熒光蛋白顯示閃爍的活動(dòng)可以由外部照明的影響的特性。有明顯分別發(fā)射和非發(fā)射新的發(fā)射狀態(tài),所表達(dá)的內(nèi)容屬性光可活化,photoconvertible的的或光開關(guān),光學(xué)熒光筆蛋白突變的熒光蛋白。另一個(gè)有趣的類型的熒光蛋白熒光定時(shí)器能夠改變它們的顏色隨著時(shí)間的推移。下面的文章將給予這些“特殊”的熒光蛋白的選擇的概述。


Dronpa-0_04



 

光活化的蛋白

光活化的蛋白可以“接通”從低熒光狀態(tài)到一個(gè)更高的熒光狀態(tài)。此開關(guān)期間發(fā)生的事件的第二小于施加短暫的光脈沖在紫色/藍(lán)色光譜,并允許動(dòng)態(tài)細(xì)胞過程的檢測。感興趣的區(qū)域(ROI)中的分子定向光活化可用于監(jiān)測這些被激活的細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)的運(yùn)動(dòng)。而像FRAP在其他脈沖追逐的實(shí)驗(yàn)設(shè)置一個(gè)不能區(qū)分蛋白質(zhì)重新進(jìn)入的投資回報(bào)率和新合成的分子,光敏繞過這個(gè)問題的方法之一。

 

第一光活化的蛋白是一個(gè)wtGFP變體,并,,由Lippincott-Schwarz和帕特森已經(jīng)建立。它包括的單點(diǎn)突變(T203H),這會(huì)導(dǎo)致一個(gè)非常低的區(qū)域從450到550nm的吸光度。被光活化與紫色光的幫助下,PA-GFP(綠色熒光蛋白光活化的)開關(guān)從400到504 nm的最大吸收。因此,其熒光增加CA。100倍,當(dāng)用波長為488 nm,什么樣的是反映在激活的和未激活的蛋白之間形成了鮮明對比激發(fā)[ 1 ]。

 

PA-GFP的激活過程中的基本過程似乎是谷氨酸的側(cè)鏈殘基222的光致脫羧。這種損失的二氧化碳改變了發(fā)色基團(tuán)的配置從一個(gè)中性的陰離子狀態(tài)[ 2 ]。

 

這里應(yīng)該提到另一個(gè)候選是Phamret(光活化介導(dǎo)的共振能量轉(zhuǎn)移),這是一個(gè)特殊的串聯(lián)二聚體的熒光蛋白,光活化的熒光共振能量轉(zhuǎn)移。phamret的融合蛋白組成的一個(gè)PA-綠色熒光蛋白的共價(jià)耦合到FRET伙伴ECFP。在480 nm到458 nm波長的曝光導(dǎo)致排放ECFP。相鄰光敏PA-GFP有405nm的激光束。在這之后,反復(fù)暴露于458納米導(dǎo)致FRET激發(fā)ECFP和PA-GFP之間的,在綠色熒光。因此,“無效”和“活躍”的形式,可以激發(fā)出相同的激光波長。可能是負(fù)的特性的蛋白質(zhì)的大小,這是由兩個(gè)熒光蛋白,可能喚起空間位阻問題。

 

值得注意的是,光活化的蛋白通常顯示降低亮度相比,EGFP的耐光性降低,并顯示出。


Highlighter-Proteins-Figure-1


圖 1:光激活FPS可以切換“開”藍(lán)色/紫色光譜光照射在熒光狀態(tài)從非熒光狀態(tài)。Photoconvertable的FPS是能夠改變他們的熒光發(fā)射光譜,從一個(gè)到另一個(gè)最大。這也被觸發(fā),通過曝光與目標(biāo)波長的光??梢郧袚Q光開關(guān)的FP“開和關(guān)”的兩個(gè)不同波長的光脈沖的幫助。該循環(huán)可以執(zhí)行至幾百倍。改變其發(fā)射光譜熒光計(jì)時(shí)器時(shí)間。在他們的幫助下,它是可能的關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì),例如年齡和蜂窩位置

 

Photoconvertible蛋白質(zhì)


在光活化的蛋白相比,photoconvertible發(fā)出熒光的蛋白質(zhì)已經(jīng)在他們的非轉(zhuǎn)換的狀態(tài)。因此,它是更容易定義您的投資回報(bào)率。光電轉(zhuǎn)換被發(fā)現(xiàn)在石開腦珊瑚Trachyphyllia geoffroyi中。由于其排放的屬性,正在從綠色變?yōu)榧t色光轉(zhuǎn)化后用紫外光,熒光蛋白被命名為楓像日本槭樹的葉子[ 4 ]。秋天,他們把顏色從綠色變?yōu)榧t色。如果楓380和400納米之間的波長,其最大發(fā)射光轉(zhuǎn)換正在發(fā)生變化,從518納米到582納米。這顯示在綠色和紅色熒光的因素2,000之間的比例大幅改變。這種轉(zhuǎn)換是不可逆的。另一個(gè)限制因素是楓四聚體的性質(zhì),是什么使活細(xì)胞成像研究它,而沒有吸引力。

 

光轉(zhuǎn)化的基本過程又是一個(gè)光誘導(dǎo)過程。在這種情況下,內(nèi)部的發(fā)色團(tuán)(His61-Tyr63-Gly64)組氨酸殘基被裂解的照射,并最終導(dǎo)致一個(gè)形成一個(gè)高度共軛的雙咪唑環(huán)系統(tǒng)。這個(gè)過程被連接到紅色波長[ 2 ] 熒光移位。

 

一個(gè)紅色綠色兌換FP來自珊瑚Dendronephtytha SP。它的名字和紅色的激活屬性都反映表達(dá)將Dendra [ 5 ]。商業(yè)發(fā)展Dendra2是第一單體紅-綠色photoconvertible的蛋白質(zhì)。

 

另一種廣泛使用的光學(xué)熒光筆tdEosFP [ 6 ],主要是從Labophyllia hemprichii,石珊瑚隔離。串聯(lián)二聚體可以轉(zhuǎn)換從綠色到紅色熒光的近紫外線照射后,欣然用于超分辨率顯微鏡,什么是真正的單體版本MEOS mEos2個(gè)。

 

非常相似的特征Keadeàphotoconvertible的蛋白質(zhì)被發(fā)現(xiàn)在第三個(gè)石珊瑚:法維亞瘌痢。近紫外線照射四聚體KikGR的后改變其熒光從綠色變?yōu)榧t色,但在一個(gè)更美好的方式比楓。其商業(yè)的變體被稱為Kikume,可以用750 nm波長的多光子激發(fā)的光轉(zhuǎn)換。類似這樣的,它可以被用來在厚的組織標(biāo)本。突變導(dǎo)致KikGR單體形式mKikGR的。連同與mEos2 Dendra2它是一個(gè)經(jīng)常使用的光學(xué)超分辨成像熒光筆。

 

光開關(guān)染料


而光敏化是一個(gè)不可逆轉(zhuǎn)的轉(zhuǎn)換,從一個(gè)非熒光狀態(tài)的熒光狀態(tài),光開關(guān)蛋白能兩個(gè)條件之間的班車。不同波長的光脈沖,這些熒光蛋白的幫助,可以打開和關(guān)閉的幾百倍不漂白。熒光燈和暗態(tài)之間進(jìn)行切換,這樣的現(xiàn)象,被稱為光致變色的,已經(jīng)顯示了在單分子水平wtGFP,但一個(gè)非常低的延伸。

 

一個(gè)眾所周知的光開關(guān)的蛋白質(zhì),它是用來在超高分辨率顯微鏡,是來自于一個(gè)石珊瑚:Dronpa是單體,并在390 nm處的最大吸收波長為503納米,由于它的陰離子,去質(zhì)子化的發(fā)色團(tuán),有小absoption最大由于它的中性,質(zhì)子化的發(fā)色團(tuán)。而陰離子形式在518 nm處具有最大發(fā)射,中性的形式描繪了一個(gè)非熒光狀態(tài)。此外,還有一個(gè)順式-反式異構(gòu)化,質(zhì)子化的發(fā)色團(tuán)連接。的發(fā)色基團(tuán)的中性態(tài)Tyr66的側(cè)鏈中的反式構(gòu)型(第2圖)。在其陰離子國家Tyr66具有順式構(gòu)象。有405nm照射后,被強(qiáng)制進(jìn)入激光脈沖Dronpa的熒光順式構(gòu)象。488 nm激光脈沖然后切換Dronpa的構(gòu)象非熒光反狀態(tài)。該循環(huán)可以重復(fù)幾百次。


Dronpa-Dark-state-state_02




Dronpa-0_04


圖2:使用超高分辨率顯微鏡的光開關(guān)蛋白Dronpa的

 

 

四聚體蛋白在紅色區(qū)域的最大發(fā)射光開關(guān)Kindling FP(KFP1)。

 

最新努力創(chuàng)造新的光學(xué)熒光筆想出了這是一種蛋白質(zhì),光電轉(zhuǎn)換和光控相結(jié)合。IrisFP是一個(gè)wtEosFP的一個(gè)開和關(guān)的開關(guān)狀態(tài),以及其綠色熒光紅色熒光構(gòu)衍生。換句話說,照射高強(qiáng)度的405nm的激光束IrisFP后轉(zhuǎn)移從綠色到紅色的發(fā)光狀態(tài)。格林IrisFP的可以被關(guān)掉的幫助下為488 nm的激光。在405納米的低強(qiáng)度激光開關(guān)再次打開。紅IrisFP另一方面關(guān)閉用532 nm的激光的光,并且可以具有440 nm的激光再次接通。相鄰的建設(shè)單體形式mIrisFP的打開門為進(jìn)一步的應(yīng)用[ 3 ]。

 

熒光計(jì)時(shí)器


正在改變他們的發(fā)射光譜的時(shí)間被稱為熒光蛋白的熒光計(jì)時(shí)器。此行為是不pH值的變化,離子強(qiáng)度或蛋白質(zhì)濃度的結(jié)果,但獨(dú)立于這些生化指標(biāo)發(fā)生。換句話說有關(guān)的蛋白的年齡可以估算它的顏色。具有這些特征的,有可能測量在活細(xì)胞內(nèi)的時(shí)間-時(shí)間取決于發(fā)生的事情- 。

 

在2000年,由實(shí)驗(yàn)室的謝爾蓋·A.盧科亞諾夫第一熒光定時(shí)器描述。這種紅色熒光蛋白突變體命名為FT(熒光定時(shí)器)改變其發(fā)射光譜在18小時(shí)期間從紅色到綠色波長。由于這樣的事實(shí),F(xiàn)T的四聚體Vladislav Verkhusha的看到有必要?jiǎng)?chuàng)造一個(gè)單體的。突變的mCherry導(dǎo)致3熒光定時(shí)器,具有不同的轉(zhuǎn)換時(shí)間。這些蛋白質(zhì)被轉(zhuǎn)向快速,中速或慢速的時(shí)間尺度從藍(lán)色到紅色,但仍然太慢測量細(xì)胞在幾分鐘內(nèi)發(fā)生的進(jìn)程(S. 表1)。

 

然而,隨著熒光計(jì)時(shí)器的幫助下,它未能觀看蛋白在活細(xì)胞中,無論是在空間和時(shí)間分辨率的行為。例如,分化和細(xì)胞極化過程可以觀察到。此外,蛋白質(zhì)運(yùn)輸?shù)氖录虿《狙b配可以跟蹤或基因的活性可以被監(jiān)控。該應(yīng)用程序列表中一定能進(jìn)行擴(kuò)展和顯示熒光定時(shí)器在未來的潛在用途

 

表1:螢光蛋白和熒光計(jì)時(shí)器


 蛋白質(zhì)


前最大(NM)


EM 最大(NM)


QY


亮度


PK 一


結(jié)構(gòu)


雜項(xiàng)


光活化的蛋白


 


 


 


 


 


 


激活狀態(tài)


PA-GFP


400 
504


515 
517


0.13 
0.79


2.7 
14


 


單體


紫色


Phamret


458 
458


475 
517


0.40 
0.79


13 
14


 


單體


紫色


Photoconvertible 
 蛋白質(zhì)


 


 


 


 


 


 


轉(zhuǎn)換條件


Dendra2


490 
553


507 
573


0.50 
0.55


22 
19


6.6 
6.9


單體


初始狀態(tài)
紫羅蘭


Kaede


508 
572


518 
580


0.88 
0.33


87 
20


 


四聚體


初始狀態(tài)
紫羅蘭


mEos2


506 
573


519 
584


0.84 
0.55


47 
30


5.6 
6.4


單體


初始狀態(tài)
紫羅蘭


mKikGR


505 
580


515 
591


0.69 
0.63


34 
18


ND 
ND


單體


初始狀態(tài)
紫羅蘭


光開關(guān)的蛋白質(zhì)


 


 


 


 


 


 


條件激活(淬滅)


Dronpa


503


518


0.85


80.8


5.0


單體


紫(藍(lán)色)的


Kindling FP (KFP1)


580


600


0.07


4.1


ND


四聚體


綠色(450納米)


Photoconvertible /
 光開關(guān)的蛋白質(zhì)


 


 


 


 


 


 


 


IrisFP


488 
551


516 
580


0.43 
0.47


22 
17


 


四聚體


 


mIrisFP


486 
546


516 
578


0.54 
0.59


25 
19


5.4 
7.6


單體


紫(深綠色),
青色(紅色到暗)
紫(綠到紅)


熒光計(jì)時(shí)器


 


 


 


 


 


 


轉(zhuǎn)換時(shí)間(h)


Slow-FT


402 
583


465 
604


0.35 
0.05


12 
4


2.6 
4.6


單體


9.8 
28


Medium-FT


401 
579


464 
600


0.41 
0.08


18 
6


2.7 
4.7


單體


1.2 
3.9


Fast-FT


403 
583


466 
606


0.30 
0.09


15 
7


2.8 
4.1


單體


0.25 
7.1


mK-Go


500 
548


509 
561


ND 
ND


ND 
ND


6.0 
4.8


單體


10


Exmax:最大激發(fā),Emmax:最大發(fā)射,QY:量子產(chǎn)率,亮度計(jì)算量子產(chǎn)率和摩爾消光系數(shù)的乘積除以1,000