徠卡顯微鏡:螢光蛋白及熒光計(jì)時(shí)器
術(shù)語“螢光蛋白”結(jié)合了一組基因改變的熒光蛋白,具有非常特殊的屬性:它們可以從一個(gè)非熒光狀態(tài)激活,他們可以改變他們的發(fā)射光譜或進(jìn)行切換和關(guān)閉,他們甚至能夠“為很多次。此行為是由于一些獨(dú)特的照片的物理屬性。在單分子水平,許多熒光蛋白顯示閃爍的活動(dòng)可以由外部照明的影響的特性。有明顯分別發(fā)射和非發(fā)射新的發(fā)射狀態(tài),所表達(dá)的內(nèi)容屬性光可活化,photoconvertible的的或光開關(guān),光學(xué)熒光筆蛋白突變的熒光蛋白。另一個(gè)有趣的類型的熒光蛋白熒光定時(shí)器能夠改變它們的顏色隨著時(shí)間的推移。下面的文章將給予這些“特殊”的熒光蛋白的選擇的概述。
光活化的蛋白
光活化的蛋白可以“接通”從低熒光狀態(tài)到一個(gè)更高的熒光狀態(tài)。此開關(guān)期間發(fā)生的事件的第二小于施加短暫的光脈沖在紫色/藍(lán)色光譜,并允許動(dòng)態(tài)細(xì)胞過程的檢測。感興趣的區(qū)域(ROI)中的分子定向光活化可用于監(jiān)測這些被激活的細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)的運(yùn)動(dòng)。而像FRAP在其他脈沖追逐的實(shí)驗(yàn)設(shè)置一個(gè)不能區(qū)分蛋白質(zhì)重新進(jìn)入的投資回報(bào)率和新合成的分子,光敏繞過這個(gè)問題的方法之一。
第一光活化的蛋白是一個(gè)wtGFP變體,并,,由Lippincott-Schwarz和帕特森已經(jīng)建立。它包括的單點(diǎn)突變(T203H),這會(huì)導(dǎo)致一個(gè)非常低的區(qū)域從450到550nm的吸光度。被光活化與紫色光的幫助下,PA-GFP(綠色熒光蛋白光活化的)開關(guān)從400到504 nm的最大吸收。因此,其熒光增加CA。100倍,當(dāng)用波長為488 nm,什么樣的是反映在激活的和未激活的蛋白之間形成了鮮明對比激發(fā)[ 1 ]。
PA-GFP的激活過程中的基本過程似乎是谷氨酸的側(cè)鏈殘基222的光致脫羧。這種損失的二氧化碳改變了發(fā)色基團(tuán)的配置從一個(gè)中性的陰離子狀態(tài)[ 2 ]。
這里應(yīng)該提到另一個(gè)候選是Phamret(光活化介導(dǎo)的共振能量轉(zhuǎn)移),這是一個(gè)特殊的串聯(lián)二聚體的熒光蛋白,光活化的熒光共振能量轉(zhuǎn)移。phamret的融合蛋白組成的一個(gè)PA-綠色熒光蛋白的共價(jià)耦合到FRET伙伴ECFP。在480 nm到458 nm波長的曝光導(dǎo)致排放ECFP。相鄰光敏PA-GFP有405nm的激光束。在這之后,反復(fù)暴露于458納米導(dǎo)致FRET激發(fā)ECFP和PA-GFP之間的,在綠色熒光。因此,“無效”和“活躍”的形式,可以激發(fā)出相同的激光波長。可能是負(fù)的特性的蛋白質(zhì)的大小,這是由兩個(gè)熒光蛋白,可能喚起空間位阻問題。
值得注意的是,光活化的蛋白通常顯示降低亮度相比,EGFP的耐光性降低,并顯示出。
圖 1:光激活FPS可以切換“開”藍(lán)色/紫色光譜光照射在熒光狀態(tài)從非熒光狀態(tài)。Photoconvertable的FPS是能夠改變他們的熒光發(fā)射光譜,從一個(gè)到另一個(gè)最大。這也被觸發(fā),通過曝光與目標(biāo)波長的光??梢郧袚Q光開關(guān)的FP“開和關(guān)”的兩個(gè)不同波長的光脈沖的幫助。該循環(huán)可以執(zhí)行至幾百倍。改變其發(fā)射光譜熒光計(jì)時(shí)器時(shí)間。在他們的幫助下,它是可能的關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì),例如年齡和蜂窩位置
Photoconvertible蛋白質(zhì)
在光活化的蛋白相比,photoconvertible發(fā)出熒光的蛋白質(zhì)已經(jīng)在他們的非轉(zhuǎn)換的狀態(tài)。因此,它是更容易定義您的投資回報(bào)率。光電轉(zhuǎn)換被發(fā)現(xiàn)在石開腦珊瑚Trachyphyllia geoffroyi中。由于其排放的屬性,正在從綠色變?yōu)榧t色光轉(zhuǎn)化后用紫外光,熒光蛋白被命名為楓像日本槭樹的葉子[ 4 ]。秋天,他們把顏色從綠色變?yōu)榧t色。如果楓380和400納米之間的波長,其最大發(fā)射光轉(zhuǎn)換正在發(fā)生變化,從518納米到582納米。這顯示在綠色和紅色熒光的因素2,000之間的比例大幅改變。這種轉(zhuǎn)換是不可逆的。另一個(gè)限制因素是楓四聚體的性質(zhì),是什么使活細(xì)胞成像研究它,而沒有吸引力。
光轉(zhuǎn)化的基本過程又是一個(gè)光誘導(dǎo)過程。在這種情況下,內(nèi)部的發(fā)色團(tuán)(His61-Tyr63-Gly64)組氨酸殘基被裂解的照射,并最終導(dǎo)致一個(gè)形成一個(gè)高度共軛的雙咪唑環(huán)系統(tǒng)。這個(gè)過程被連接到紅色波長[ 2 ] 熒光移位。
一個(gè)紅色綠色兌換FP來自珊瑚Dendronephtytha SP。它的名字和紅色的激活屬性都反映表達(dá)將Dendra [ 5 ]。商業(yè)發(fā)展Dendra2是第一單體紅-綠色photoconvertible的蛋白質(zhì)。
另一種廣泛使用的光學(xué)熒光筆tdEosFP [ 6 ],主要是從Labophyllia hemprichii,石珊瑚隔離。串聯(lián)二聚體可以轉(zhuǎn)換從綠色到紅色熒光的近紫外線照射后,欣然用于超分辨率顯微鏡,什么是真正的單體版本MEOS mEos2個(gè)。
非常相似的特征Keadeàphotoconvertible的蛋白質(zhì)被發(fā)現(xiàn)在第三個(gè)石珊瑚:法維亞瘌痢。近紫外線照射四聚體KikGR的后改變其熒光從綠色變?yōu)榧t色,但在一個(gè)更美好的方式比楓。其商業(yè)的變體被稱為Kikume,可以用750 nm波長的多光子激發(fā)的光轉(zhuǎn)換。類似這樣的,它可以被用來在厚的組織標(biāo)本。突變導(dǎo)致KikGR單體形式mKikGR的。連同與mEos2 Dendra2它是一個(gè)經(jīng)常使用的光學(xué)超分辨成像熒光筆。
光開關(guān)染料
而光敏化是一個(gè)不可逆轉(zhuǎn)的轉(zhuǎn)換,從一個(gè)非熒光狀態(tài)的熒光狀態(tài),光開關(guān)蛋白能兩個(gè)條件之間的班車。不同波長的光脈沖,這些熒光蛋白的幫助,可以打開和關(guān)閉的幾百倍不漂白。熒光燈和暗態(tài)之間進(jìn)行切換,這樣的現(xiàn)象,被稱為光致變色的,已經(jīng)顯示了在單分子水平wtGFP,但一個(gè)非常低的延伸。
一個(gè)眾所周知的光開關(guān)的蛋白質(zhì),它是用來在超高分辨率顯微鏡,是來自于一個(gè)石珊瑚:Dronpa是單體,并在390 nm處的最大吸收波長為503納米,由于它的陰離子,去質(zhì)子化的發(fā)色團(tuán),有小absoption最大由于它的中性,質(zhì)子化的發(fā)色團(tuán)。而陰離子形式在518 nm處具有最大發(fā)射,中性的形式描繪了一個(gè)非熒光狀態(tài)。此外,還有一個(gè)順式-反式異構(gòu)化,質(zhì)子化的發(fā)色團(tuán)連接。的發(fā)色基團(tuán)的中性態(tài)Tyr66的側(cè)鏈中的反式構(gòu)型(第2圖)。在其陰離子國家Tyr66具有順式構(gòu)象。有405nm照射后,被強(qiáng)制進(jìn)入激光脈沖Dronpa的熒光順式構(gòu)象。488 nm激光脈沖然后切換Dronpa的構(gòu)象非熒光反狀態(tài)。該循環(huán)可以重復(fù)幾百次。
圖2:使用超高分辨率顯微鏡的光開關(guān)蛋白Dronpa的
四聚體蛋白在紅色區(qū)域的最大發(fā)射光開關(guān)Kindling FP(KFP1)。
最新努力創(chuàng)造新的光學(xué)熒光筆想出了這是一種蛋白質(zhì),光電轉(zhuǎn)換和光控相結(jié)合。IrisFP是一個(gè)wtEosFP的一個(gè)開和關(guān)的開關(guān)狀態(tài),以及其綠色熒光紅色熒光構(gòu)衍生。換句話說,照射高強(qiáng)度的405nm的激光束IrisFP后轉(zhuǎn)移從綠色到紅色的發(fā)光狀態(tài)。格林IrisFP的可以被關(guān)掉的幫助下為488 nm的激光。在405納米的低強(qiáng)度激光開關(guān)再次打開。紅IrisFP另一方面關(guān)閉用532 nm的激光的光,并且可以具有440 nm的激光再次接通。相鄰的建設(shè)單體形式mIrisFP的打開門為進(jìn)一步的應(yīng)用[ 3 ]。
熒光計(jì)時(shí)器
正在改變他們的發(fā)射光譜的時(shí)間被稱為熒光蛋白的熒光計(jì)時(shí)器。此行為是不pH值的變化,離子強(qiáng)度或蛋白質(zhì)濃度的結(jié)果,但獨(dú)立于這些生化指標(biāo)發(fā)生。換句話說有關(guān)的蛋白的年齡可以估算它的顏色。具有這些特征的,有可能測量在活細(xì)胞內(nèi)的時(shí)間-時(shí)間取決于發(fā)生的事情- 。
在2000年,由實(shí)驗(yàn)室的謝爾蓋·A.盧科亞諾夫第一熒光定時(shí)器描述。這種紅色熒光蛋白突變體命名為FT(熒光定時(shí)器)改變其發(fā)射光譜在18小時(shí)期間從紅色到綠色波長。由于這樣的事實(shí),F(xiàn)T的四聚體Vladislav Verkhusha的看到有必要?jiǎng)?chuàng)造一個(gè)單體的。突變的mCherry導(dǎo)致3熒光定時(shí)器,具有不同的轉(zhuǎn)換時(shí)間。這些蛋白質(zhì)被轉(zhuǎn)向快速,中速或慢速的時(shí)間尺度從藍(lán)色到紅色,但仍然太慢測量細(xì)胞在幾分鐘內(nèi)發(fā)生的進(jìn)程(S. 表1)。
然而,隨著熒光計(jì)時(shí)器的幫助下,它未能觀看蛋白在活細(xì)胞中,無論是在空間和時(shí)間分辨率的行為。例如,分化和細(xì)胞極化過程可以觀察到。此外,蛋白質(zhì)運(yùn)輸?shù)氖录虿《狙b配可以跟蹤或基因的活性可以被監(jiān)控。該應(yīng)用程序列表中一定能進(jìn)行擴(kuò)展和顯示熒光定時(shí)器在未來的潛在用途
表1:螢光蛋白和熒光計(jì)時(shí)器
蛋白質(zhì) | 前最大(NM) | EM 最大(NM) | QY | 亮度 | PK 一 | 結(jié)構(gòu) | 雜項(xiàng) |
光活化的蛋白 |
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| 激活狀態(tài) |
PA-GFP | 400 | 515 | 0.13 | 2.7 |
| 單體 | 紫色 |
Phamret | 458 | 475 | 0.40 | 13 |
| 單體 | 紫色 |
Photoconvertible |
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| 轉(zhuǎn)換條件 |
Dendra2 | 490 | 507 | 0.50 | 22 | 6.6 | 單體 | 初始狀態(tài) |
Kaede | 508 | 518 | 0.88 | 87 |
| 四聚體 | 初始狀態(tài) |
mEos2 | 506 | 519 | 0.84 | 47 | 5.6 | 單體 | 初始狀態(tài) |
mKikGR | 505 | 515 | 0.69 | 34 | ND | 單體 | 初始狀態(tài) |
光開關(guān)的蛋白質(zhì) |
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| 條件激活(淬滅) |
Dronpa | 503 | 518 | 0.85 | 80.8 | 5.0 | 單體 | 紫(藍(lán)色)的 |
Kindling FP (KFP1) | 580 | 600 | 0.07 | 4.1 | ND | 四聚體 | 綠色(450納米) |
Photoconvertible / |
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IrisFP | 488 | 516 | 0.43 | 22 |
| 四聚體 |
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mIrisFP | 486 | 516 | 0.54 | 25 | 5.4 | 單體 | 紫(深綠色), |
熒光計(jì)時(shí)器 |
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| 轉(zhuǎn)換時(shí)間(h) |
Slow-FT | 402 | 465 | 0.35 | 12 | 2.6 | 單體 | 9.8 |
Medium-FT | 401 | 464 | 0.41 | 18 | 2.7 | 單體 | 1.2 |
Fast-FT | 403 | 466 | 0.30 | 15 | 2.8 | 單體 | 0.25 |
mK-Go | 500 | 509 | ND | ND | 6.0 | 單體 | 10 |
Exmax:最大激發(fā),Emmax:最大發(fā)射,QY:量子產(chǎn)率,亮度計(jì)算量子產(chǎn)率和摩爾消光系數(shù)的乘積除以1,000